Keanekaragaman sampah yang ditinggalkan pengunjung di sekitar PPLH-Ecolodge memberikan ide untuk membuat tempat sampah yang terpisah antara sampah organik dan anorganik agar bisa di daur ulang menjadi benda yang bermanfaat.
Untuk sampah organik, diolah menjadi kompos di Gudang Kompos PPLH Bohorok, dilakukan staf PPLH Bohorok Divisi Pengelolaan sampah bersama masyarakat setempat. Kompos yang dihasilkan digunakan sebagai pupuk di kebun – kebun masyarakat dan PPLH Bohorok. Melalui kegiatan ini PPLH Bohorok dapat mentransfer cara mengolah sampah organik menjadi kompos ke masyarakat setempat sehingga volume sampah organik bisa dikurangi..
Untuk sampah anorganik, dapat dijual ke penampungan seperti botol plastik, botol kaca, kotak kardus, besi tua, kaleng minuman.
Untuk sampah kertas, diolah menjadi kertas daur ulang. Proses ini diajarkan kepada anak-anak sekolah atau siapa saja yang berminat mempelajarinya karena caranya mudah dan menyenangkan, dan bisa di coba langsung di rumah. Kertas daur ulang ini dipakai untuk membuat kerajinan tangan seperti album foto, buku, kartu ucapan, sampul, amplop, bingkai foto, atau kertas surat bisa untuk ijual atau dipakai sendiri.
Proses pengolahan sampah di PPPLH Bohorok, di gudang kompos dan pembuatan daur ulang kertas menjadi daya tarik tersendiri bagi pengunjung PPLH Bohorok. Oleh karena itu, kegiatan ini dijadikan media pendidikan lingkungan hidup untuk anak-anak sekolah dan pengunjung PPLH Bohorok.